原作的特别版中描绘的追加了L和怀米斯小屋的孩子们对话的场面
本篇从月通过高田向基拉代理中的魅上可命令的状态开始因此从一开始海砂就没有笔记本的记忆
月 TV版演出的基拉反对派魅上照全部肃清的场面追加
第三本的笔记小故事全部被省略随之发生了以下的变更点
只有在影片开头包括尼娅的回忆场面和夺回照片绑架高田时才有出现
黑手党和死神都不登场
特别版K成员的大量杀戮从梅洛和黑手党变成了基拉月从美国总统那里敲诈成员名单高田将其传达给魅上并让他写在笔记本上
夜神总一郎已被排除在搜查之外虽然他还活着但他不会登场
伊尔拉特的名字和肖恩丹利比的本名的设定复活本人和 TV版系列一样只是特别版K的成员
梅洛将自己调查的基拉信息经由丽德纳提供给了尼亚尼亚在梅洛取回照片之前确信笔记本上的规则是假的梅洛脸上的烧伤是存在的
尼亚与夜神月的首次接触是在与高田幽会之后的手机通话同时此时也在呼吁其他搜查人员
高田知道X基拉的真正身份是魅上
马特在原作及 TV版系列中被绑架到高田时被杀害但在特别版中却只字不提
随着原作及 TV版系列中高田知道梅洛本名的情节被删除追加了高田拥有死神之眼的设定
除去月的日本搜查本部的成员和包含尼亚的特别版K的成员认知琉克的描写被删除故事在一次都没有见面的情况下进行
最后追加了相泽和松田发现月之遗体的场面魅上和月之遗体分别放映的片段
