这是五十年后的未来世界被神吞噬殆尽而荒芜的架空故事由于遭到突如其来的怪物荒神的破坏而失去平衡在人类文明既有的兵器都因荒神的捕食本能而无效化下生化科技企业芬里尔成功利用荒神细胞开发出了名为神机的生物兵器并同时组织了特殊部队GODEATER自此人类终于获得了与荒神对抗的力量 于是追求知性之极致的荒神与追求物种延续的人类之间的战争便此展开在破灭的尽头究竟是神会先成为人还是人会先成为神呢竞争开始了GODEATER的任务是把靠近地下居住区的荒神击退并且把荒神的核心和素材带回在这样的背景下玩家将会扮演一名神机使开始了与死亡擦身而过的每一天
明治时代随着文明开化及迅速西化使得日本进入前所未有的改革期 无法接受这种变化的人及对于新政府有所不满的人因此犯下罪过而囚禁这些罪犯的地方便是位于日本最大湖琵琶湖湖心的巨树监狱以作为摆渡人代代供奉大蛇的阴天神社三兄弟为中心各式各样的现实与未解之谜交错潇洒奢华的故事终于揭开序幕
