1991年6月29日土に東宝系にて劇場公開作品 TV版のラストから3年後のストーリーテレビ版から続投するのはナディアとジャングランディスサンソンハンソンの5人だけでありマリーやキングエアトンエレクトラを始めとするノーチラス号乗組員はナディアの回想シーン以外では登場しないこの回想シーンは映画序盤で断続的に30分ほど続き作画はテレビ版の流用であるTV版最終回で存在が明らかになったエレクトラとネモ船長の子供も登場しない 当初はガイナックスが制作する予定だったが監督の庵野秀明はテレビ版で燃え尽きたとして担当せずプロットとキャラクターデザインを作った段階でガイナックスは予算を使い果たしてなお完成させることができず残りをグループ・タックが制作したガイナックスはプロットとデザインの他劇中のテレビ版のダイジェストの編集のみを担当そういったドタバタが災いしてか映画自体は高い評価は得られなかった武田康廣の回想録によればこのときグループ・タックに踏み倒した格好の5000万円が返済されるのは『新世紀エヴァンゲリオン』のヒット以降になる
