故事开始于墓地Horatio Caine正在教堂向神父告解外面传了一阵枪声虽然破案但也为季末做了铺垫 本季加入了CSIer的一些故事Eric Delko被牵涉到大麻事件中去遭到了内务部的调查Ryan Wolfe一次调查中被针子射伤了眼睛影响了视力Horatio Caine因为Eric的事情认识了他的姐姐Mari最后还结为夫妻而这一季的主线是实验室里出现了内奸谁是内奸也搞得实验室里人心惶惶而这内奸会在第2里出现 另外第2也给下一季做了一个铺垫因为第出现的黑帮向Horatio报仇射杀了他的妻子而因为FBI的介入黑帮份子被押到了巴西Horatio和Eric为了将他绳之于法决定也随去
O记督查王志淙黄日华 饰和上司陈桂蔡国权 饰结为搭档共同打击罪恶弘扬正义然而当王志淙出差归来之时却发现陈桂已经离职而接任陈桂成为自己搭档的竟然是平日里就同自宿怨良多的国际刑警高级督察梁家伟罗嘉良 饰再加上他们同时喜欢上了名为方小芳黎姿 饰的美丽导游小姐彼此之间的关系更是水火不容一场没有硝烟的战争似乎正要拉开序幕 就在这个节骨眼上王志淙的旧搭档林永泰陈锦鸿 饰意外回归可是此时的他亦麻烦缠身陷入了感情漩涡之中无法自拔罪犯们可没有假期繁华的大都市中每时每刻都在发生着犯罪行动人心涣散的O记能否再次齐心合力
有一个3个月后即将变成尘灰消失的男人90天后虽然地球上少了一个人但地球还是会正常的运行相信活着的妻子还是会停止流泪会勇敢地活下去那么在死之前能不能向妻子请剩下的90天假呢2006年的秋天命运让一对男女相遇相爱但又对他们开了一个玩笑使他们分开……
