故事发生在异世界中在这里被称为噬神者的鬼怪潜伏在人群之中散播着恐惧和危险在一场浩浩荡荡而又旷日持久的战争之后人类终于以伤亡惨重为代价将噬神者们封印在了三层结界之后然而随着时间的流逝第一层结界碎裂了这也就意味着如果坐视不管的话数百年前的悲剧将要重演 就在这个危急关头身形纤弱但拥有着强大力量的少女们出现了天真乐观的静御前铃木爱奈 配音温柔冷静的义经松井惠理子 配音嗜酒如命的茨木童子三森铃子 配音捉摸不透的辉夜橘田泉 配音可爱娇小的天照原奈津子 配音这些少女们要对抗的是名为撒旦的最强噬神者
2013年因为修学旅行而来到台湾的女高中生小椋汐遭到了突然出现的怪兽进化侵略体的袭击在军队完全没用的时候谜之男子们出现在面前他们是超国家机关DOGOO的代理人继承了伟人之魂并将这股力量用之战斗的E遗传子持有者终于在友人面临危机之际小椋汐身上的伟人之魂也觉醒了
宇宙历八世纪末帝国历五世纪末在卡布契兰加行星之战建立功勋的莱茵哈特·冯·缪杰尔获得基地副司令官推荐晋升中尉成为宇宙舰队哈梅隆二号驱逐舰的航海长好友齐格飞·吉尔菲艾斯也晋升少尉成为该舰的保安主任出身贵族加之年纪尚轻两位好友甫一到来招致上到副舰长下到二等兵的颇多非议和不信任莱茵哈特和吉尔菲艾斯凭借勇猛果敢与超越阶级的平等观念赢得下级士兵的尊重在航行至亚特密尔恒星系时哈梅隆二号遭遇自由行星同盟舰队的伏击身受重伤的舰长临时将指挥权交予莱茵哈特但副舰长则强硬坚持自己的理念少年英雄的建功之路荆棘重重…… 本片根据田中芳树的经典科幻小说改编
